Znak města Libochovice se vyvinul z městské pečeti. V pramenech je její existence zaznamenána v 16. století. Když 7. srpna 1560 povýšil císař Ferdinand I. na žádost Jana nejstaršího z Lobkovic (+ 1569) Libochovice na město, bylo součástí privilegia císařovo svolení „aby již místo toho zeleného vosku červeným voskem nyní a na budoucí věčné časy pečetili“. Svědčí to o faktu, že již před tím byla v Libochovicích užívána pečeť. To také znamená, že obec disponovala vyspělou kanceláří a nejspíše se řídila městskými právy již před povýšením na město. Ostatně magdeburským městským právem se obec řídila již od roku 1292, kdy jí to vydanou listinou umožnil znak a vlajka města LibochoviceHeiman z Lichtenburka vlastník hradu Klapý a jeho okolí. Městečkem jsou Libochovice výslovně nazvány v roce 1352 v listině Karla IV. pro Louny. V té době byli vlastníky hradu Klapý, přejmenovaného na Házmburk, Budyně nad Ohří a Libochovic již od roku 1335 příslušníci šlechtického rodu, kteří se nazývali Zajíci z Házmburka. Jejich panování v Libochovicích ukončil prodej statku v roce 1558 Krištofem Zajícem z Házmburku Janovi nejstaršímu z Lobkovic na Žebráku a Točníku. Tedy někdy v letech 1335 – 1558 vznikla tradice umísťování figury házmburského zajíce a koruny do pečetního pole typáře obecní, či městské pečeti.